Основу коллекции Музея-института составляет коллекция двоюродного брата Е.И.Рерих - С.С.Митусова, а так же другие пожертвования (рисунки и живопись сотрудников и родственников Рерихов, этнографические материалы, древние православные иконы, архивы).
Коллекция включает в себя личные вещи Рерихов, их автографы и личные записи, картины и рисунки, мебель квартир, где жили Рерихи и т.д. На момент регистрации коллекции в государственном музейном фонде, коллекция составляла 564 объекта (некоторые из них многосоставные). На данный момент коллекция значительно шире.
В постоянном фонде музея находится не очень большое количество картин, этюдов и рисунков Н.К.Рериха (порядка 30-40). Имеется так же коллекция рисунков и лепки Ю.Н.Рериха, рисунки С.Н. Рериха и т.д.
Однако музей практически постоянно проводит выставки, на которых присутствуют картины картины Рерихов. Буквально неделю назад закончила работу выставка
"Отец и сын. Произведения Николая и Святослава Рерихов", на которой были представлены картины Н.К.Рериха и С.Н.Рериха из Третьяковской галереи, Латвийского художественного музея, Исследовательского фонда Рерихов. Ранее этой выставки проходила выставка
«"Весна священная". Возвращение» с картинами более чем восьми музеев России. Еще ранее - выставка
«Начало Руси. Славяне и варяги»,
экспозиция Пермского иконостаса и т.д. Не говоря уже о таких грандиозных проектах как "
Рериховский Век". С декабря стартует выставка
«Н.К. Рерих и Эстония», на которой бут представлены картины Н.К.Рериха из Третьяковской галереи и Новгородского музея.